En el desarrollo del sistema se tuvieron en cuenta una serie de requisitos iniciales:

Facilitar la introducción de información en el sistema 

La entrada de datos se debe facilitar mediante formularios intuitivos.  Se evitará la duplicación de la introducción manual de datos, permitiendo la interconexión con otros sistemas de información mediante el uso de ficheros de intercambio.

Facilidad de acceso

Para maximizar la facilidad de acceso a Náyade, se minimizarán los requisitos  a cumplir por los sistemas informáticos de los usuarios: Navegador de internet que se ajuste a los estándares, y certificado digital emitido por una autoridad reconocida.
 
Descentralización de la administración del sistema

Cada comunidad autónoma, siguiendo un modelo descentralizado, administrará y será responsable de otorgar permisos a sus propios usuarios.

Privacidad y seguridad. 

El sistema identificará a quien carga los datos (titular) y le protegerá de accesos no autorizados garantizando su privacidad. El usuario responderá de la calidad de los datos (generación, carga y coherencia). Los datos serán objeto de especial protección mediante tecnología Internet segura, conforme al estándar X.509, que identifica a los usuarios a través de certificación digital emitida por una autoridad reconocida. Esta tecnología responde de la autenticidad, confidencialidad, e integridad de la comunicación.